Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrna5Q2MKA5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chrna5Q2MKA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms