Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Tdrd9Q14BI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tdrd9Q14BI7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tdrd9Q14BI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tdrd9Q14BI7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms