Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd3Q14AI6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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