Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Itgb8Q0VBD0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb8Q0VBD0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb8Q0VBD0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms