Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5cQ0V8T7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntnap5cQ0V8T7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms