Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Lrriq1Q0P5X1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lrriq1Q0P5X1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lrriq1Q0P5X1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Lrriq1Q0P5X1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lrriq1Q0P5X1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms