Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SobpQ0P5V2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SobpQ0P5V2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SobpQ0P5V2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SobpQ0P5V2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms