Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn2bQ0KL01 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubxn2bQ0KL01 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ubxn2bQ0KL01 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ubxn2bQ0KL01 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms