Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cntn3Q07409 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntn3Q07409 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntn3Q07409 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms