Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r236Q05A06 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r236Q05A06 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms