Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fmn1Q05860 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Fmn1Q05860 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Fmn1Q05860 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Fmn1Q05860 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Fmn1Q05860 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Fmn1Q05860 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms