Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk18Q04899 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk18Q04899 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdk18Q04899 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms