Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Emx2Q04744 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Emx2Q04744 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Emx2Q04744 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx2Q04744 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms