Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nf1Q04690 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nf1Q04690 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nf1Q04690 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms