Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hivep1Q03172 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hivep1Q03172 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hivep1Q03172 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms