Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nhlh1Q02576 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nhlh1Q02576 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nhlh1Q02576 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nhlh1Q02576 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms