Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd1Q01822 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd1Q01822 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd1Q01822 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms