Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nme2Q01768 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nme2Q01768 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme2Q01768 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms