Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Top2aQ01320 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Top2aQ01320 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2aQ01320 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Top2aQ01320 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2aQ01320 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Top2aQ01320 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms