Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbp4Q00724 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbp4Q00724 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rbp4Q00724 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms