Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SeleQ00690 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SeleQ00690 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeleQ00690 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeleQ00690 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms