Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HmmrQ00547 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms