Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp9bP98195 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp9bP98195 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp9bP98195 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp9bP98195 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp9bP98195 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp9bP98195 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp9bP98195 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp9bP98195 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms