Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VldlrP98156 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VldlrP98156 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms