Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas2P97460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas2P97460 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas2P97460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas2P97460 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas2P97460 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas2P97460 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Npas2P97460 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas2P97460 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms