Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LystP97412 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LystP97412 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LystP97412 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LystP97412 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LystP97412 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LystP97412 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LystP97412 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LystP97412 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LystP97412 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LystP97412 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LystP97412 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LystP97412 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LystP97412 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LystP97412 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LystP97412 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LystP97412 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LystP97412 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LystP97412 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LystP97412 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LystP97412 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LystP97412 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LystP97412 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LystP97412 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LystP97412 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LystP97412 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LystP97412 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LystP97412 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LystP97412 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LystP97412 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LystP97412 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LystP97412 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LystP97412 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LystP97412 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LystP97412 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LystP97412 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LystP97412 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LystP97412 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LystP97412 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LystP97412 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LystP97412 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LystP97412 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LystP97412 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LystP97412 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
LystP97412 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LystP97412 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LystP97412 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LystP97412 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LystP97412 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LystP97412 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LystP97412 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LystP97412 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LystP97412 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LystP97412 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LystP97412 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LystP97412 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LystP97412 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LystP97412 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms