Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx1P81068 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx1P81068 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx1P81068 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx1P81068 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms