Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf3P70671 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf3P70671 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf3P70671 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf3P70671 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf3P70671 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms