Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cux2P70298 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cux2P70298 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cux2P70298 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux2P70298 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cux2P70298 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cux2P70298 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux2P70298 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cux2P70298 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cux2P70298 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cux2P70298 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cux2P70298 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms