Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgif1P70284 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgif1P70284 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgif1P70284 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgif1P70284 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tgif1P70284 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tgif1P70284 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms