Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn1P70268 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn1P70268 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pkn1P70268 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkn1P70268 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms