Protein–RNA interactions for Protein: P70168

Kpnb1, Importin subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpnb1P70168 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kpnb1P70168 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kpnb1P70168 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kpnb1P70168 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms