Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Actg1P63260 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Actg1P63260 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actg1P63260 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actg1P63260 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actg1P63260 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms