Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ElobP62869 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ElobP62869 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ElobP62869 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ElobP62869 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ElobP62869 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ElobP62869 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ElobP62869 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ElobP62869 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ElobP62869 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ElobP62869 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ElobP62869 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ElobP62869 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ElobP62869 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms