Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl23P62830 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl23P62830 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms