Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gabra1P62812 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gabra1P62812 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gabra1P62812 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms