Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch1P62046 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch1P62046 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Lrch1P62046 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch1P62046 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms