Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vbp1P61759 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vbp1P61759 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vbp1P61759 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms