Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ActbP60710 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ActbP60710 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ActbP60710 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ActbP60710 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ActbP60710 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ActbP60710 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ActbP60710 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ActbP60710 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ActbP60710 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ActbP60710 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ActbP60710 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ActbP60710 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ActbP60710 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ActbP60710 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ActbP60710 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ActbP60710 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ActbP60710 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ActbP60710 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ActbP60710 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ActbP60710 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ActbP60710 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ActbP60710 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ActbP60710 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ActbP60710 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ActbP60710 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ActbP60710 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ActbP60710 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ActbP60710 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ActbP60710 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ActbP60710 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ActbP60710 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ActbP60710 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ActbP60710 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ActbP60710 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms