Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5g3P56384 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms