Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pex2P55098 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pex2P55098 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex2P55098 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex2P55098 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex2P55098 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pex2P55098 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pex2P55098 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex2P55098 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex2P55098 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms