Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb3P54754 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ephb3P54754 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ephb3P54754 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms