Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efnb1P52795 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Efnb1P52795 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Efnb1P52795 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms