Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClgnP52194 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClgnP52194 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClgnP52194 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClgnP52194 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ClgnP52194 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ClgnP52194 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClgnP52194 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClgnP52194 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClgnP52194 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClgnP52194 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClgnP52194 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClgnP52194 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms