Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn1cP49919 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn1cP49919 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdkn1cP49919 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn1cP49919 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms