Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PcntP48725 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PcntP48725 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PcntP48725 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PcntP48725 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PcntP48725 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PcntP48725 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PcntP48725 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PcntP48725 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcntP48725 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcntP48725 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PcntP48725 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PcntP48725 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PcntP48725 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PcntP48725 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PcntP48725 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcntP48725 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcntP48725 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcntP48725 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcntP48725 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcntP48725 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PcntP48725 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcntP48725 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcntP48725 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcntP48725 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PcntP48725 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcntP48725 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcntP48725 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcntP48725 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcntP48725 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PcntP48725 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PcntP48725 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcntP48725 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcntP48725 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcntP48725 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcntP48725 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcntP48725 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PcntP48725 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcntP48725 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcntP48725 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcntP48725 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcntP48725 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PcntP48725 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PcntP48725 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PcntP48725 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PcntP48725 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcntP48725 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcntP48725 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcntP48725 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PcntP48725 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PcntP48725 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcntP48725 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcntP48725 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcntP48725 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcntP48725 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms