Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcd1P48410 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd1P48410 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd1P48410 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms