Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Resp18P47939 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Resp18P47939 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Resp18P47939 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Resp18P47939 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Resp18P47939 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Resp18P47939 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Resp18P47939 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Resp18P47939 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Resp18P47939 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms