Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pax9P47242 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax9P47242 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax9P47242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms