Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HttP42859 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HttP42859 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HttP42859 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HttP42859 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HttP42859 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HttP42859 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HttP42859 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HttP42859 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HttP42859 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HttP42859 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HttP42859 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HttP42859 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HttP42859 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HttP42859 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HttP42859 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HttP42859 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HttP42859 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HttP42859 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HttP42859 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HttP42859 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HttP42859 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HttP42859 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HttP42859 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HttP42859 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HttP42859 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HttP42859 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HttP42859 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HttP42859 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HttP42859 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HttP42859 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HttP42859 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HttP42859 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HttP42859 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HttP42859 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HttP42859 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HttP42859 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HttP42859 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms